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實驗室信息化管理平臺LIMS——數(shù)據(jù)標準化管理

2019-12-25 10:05


實驗室按照不同的實驗業(yè)務(wù)將數(shù)據(jù)分類,可針對實驗項目的不同將這幾大類數(shù)據(jù)(數(shù)據(jù)文件、實驗文檔、實驗表單、實驗規(guī)程、執(zhí)行標準、多媒體數(shù)據(jù)及其它數(shù)據(jù))按照不同的數(shù)據(jù)項分類進行管理。

通過不同的數(shù)據(jù)類型劃分,管理與實驗數(shù)據(jù)相關(guān)的所有對象屬性信息、實驗文檔、實驗數(shù)據(jù)(原始數(shù)據(jù)、過程數(shù)據(jù)、結(jié)果數(shù)據(jù))、實驗表單等。

實驗室信息化管理平臺——數(shù)據(jù)管理包含對數(shù)據(jù)存儲管理,按實驗項目、實驗件、實驗臺、實驗室等組織管理實驗數(shù)據(jù)(包括實驗工藝規(guī)程卡、實驗任務(wù)書、實驗大綱、實驗檢查表、過程記錄表、實驗圖片、音頻視頻數(shù)據(jù)以及相關(guān)實驗配套文檔等)。

此外,系統(tǒng)實驗數(shù)據(jù)編碼提供實驗數(shù)據(jù)編碼服務(wù),用戶可以自行設(shè)計數(shù)據(jù)編碼規(guī)則,數(shù)據(jù)歸檔時,系統(tǒng)自動生成數(shù)據(jù)相對應(yīng)的編碼。

實驗室信息化管理平臺結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)管理,實現(xiàn)對結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)進行錄入、修改、刪除、查詢等功能的操作,具體如下:

1)原始數(shù)據(jù)管理:原始數(shù)據(jù)導入前提供導入確認措施,導入系統(tǒng)后,不可進行編輯和刪除。

2)非原始數(shù)據(jù)編輯:客戶端對有權(quán)限的用戶提供了非原始數(shù)據(jù)手工錄入、智能導入、修改和刪除的功能。

3)數(shù)據(jù)查詢:提供多種實驗數(shù)據(jù)查詢方式,包括組合查詢、高級查詢、跨型號(產(chǎn)品)/跨項目的精確查詢、模糊查詢等功能。用戶可隨意挑選任何一組字段進行檢索。對于常用的查詢,用戶還可動態(tài)地生成數(shù)據(jù)視圖來獲取和查看日常工作中經(jīng)常要使用的實驗數(shù)據(jù)。

4)數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換:本系統(tǒng)支持把各種文件格式轉(zhuǎn)換為標準格式入庫保存。本系統(tǒng)提供一個開放的接口,以便靈活地添加各種格式數(shù)據(jù)文件的數(shù)據(jù)導入導出轉(zhuǎn)換器。

實驗室信息化管理平臺——非結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)管理,實現(xiàn)圖片、視頻等非結(jié)構(gòu)化文件,以及大數(shù)據(jù)量的數(shù)據(jù)文件,通過文件的方式進行管理,該管理方式是把實驗數(shù)據(jù)以文件(附件)形式保存到數(shù)據(jù)庫中,同時在數(shù)據(jù)庫中保存實驗數(shù)據(jù)的描述信息,并且建立描述信息和數(shù)據(jù)文件的關(guān)聯(lián),以便于技術(shù)人員快速方便地查詢使用所需的實驗數(shù)據(jù)文件。管理功能主要包括文件的上傳、文件解析、文件的數(shù)據(jù)提取、文件的下載、刪除、文件在線查看、文件合并和拆分、以及文件檢索功能,能夠?qū)崿F(xiàn)將數(shù)據(jù)文件以文件的方式進行存儲,同時也可以對文件中的內(nèi)容采用結(jié)構(gòu)化的方式進行處理。

系統(tǒng)根據(jù)企業(yè)規(guī)范形成統(tǒng)一的數(shù)據(jù)格式標準,實現(xiàn)實驗數(shù)據(jù)的快速入庫,主要的功能包括:頁面錄入、海量數(shù)據(jù)導入、自動采集入庫。

1)頁面錄入

對于平臺中存儲的每類數(shù)據(jù),系統(tǒng)都提供界面下手動的添加、編輯、查詢的功能。

2)自定義表單

平臺提供自定義表單功能,滿足日常工作報表的填寫、導出、打印等功能。

3)海量結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)導入

實現(xiàn)海量結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)導入,可從各種不同格式的數(shù)據(jù)文件中提取出所需的參數(shù)信息,自動導入數(shù)據(jù)庫中,以數(shù)據(jù)庫記錄的形式進行存儲,并提供多功能的數(shù)據(jù)導入/導出功能和日志功能。

數(shù)據(jù)格式轉(zhuǎn)換導出是如何實現(xiàn)的呢?有權(quán)限的用戶可以將采集設(shè)備數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換導出成指定的格式,并提供擴展接口,定制成用戶需要的特定文件格式。

實驗室信息化管理平臺為用戶提供便捷的數(shù)據(jù)查詢功能,可通過實驗項目與實驗數(shù)據(jù)關(guān)聯(lián)結(jié)構(gòu)完成實驗數(shù)據(jù)的定位,也可以通過系統(tǒng)提供的查詢功能完成實驗數(shù)據(jù)的組合條件查詢。查詢的內(nèi)容除了系統(tǒng)默認字段外還可以根據(jù)用戶需要增加所需字段及查詢類型??蓪崿F(xiàn)多條件模糊查詢、按照關(guān)聯(lián)關(guān)系擴展查詢、可視化查詢等。

實驗室信息化管理平臺如何進行實驗數(shù)據(jù)分析應(yīng)用?

1.在線處理

1)提供各種常用的算法及多種常用的圖形繪制功能實現(xiàn)實驗數(shù)據(jù)的分析處理,快速完成數(shù)據(jù)分析處理工作,提高工作效率。

2)可以集成用戶自定義算法完成實驗數(shù)據(jù)的分析處理。

3)可以與第三方專業(yè)分析軟件集成,完成實驗數(shù)據(jù)的分析處理。

2. 數(shù)據(jù)對比分析

實現(xiàn)對來自不同實驗任務(wù)、不同實驗臺、不同實驗類別、不同狀態(tài)、不同型號的數(shù)據(jù)進行實驗數(shù)據(jù)對比,以及實驗數(shù)據(jù)和仿真結(jié)果數(shù)據(jù)的對比分析,通過數(shù)字、表格、曲線多種控件進行實驗數(shù)據(jù)對比回放,用戶可以對各類實驗進行橫向?qū)Ρ?#xff0c;對數(shù)據(jù)的深層次挖掘分析,從而為實驗的評估提供了有力的依據(jù)。提供在線對比分析、離線對比分析功能,實現(xiàn)實驗比對以及數(shù)據(jù)比對結(jié)果判讀等。

3.?數(shù)據(jù)統(tǒng)計

1)提供常用的數(shù)理統(tǒng)計計算功能,可以對一段數(shù)據(jù)進行均值、最大值、最小值、均值、方根、方差等統(tǒng)計計算;可以對數(shù)據(jù)進行積、商、和、差等簡單運算;允許用戶選擇算法庫中的算法。

2)提供統(tǒng)計定制功能,允許用戶定制各種復雜的統(tǒng)計功能。包括:設(shè)置統(tǒng)計所需的查詢條件、設(shè)置統(tǒng)計所需的計算算法、設(shè)置統(tǒng)計結(jié)果信息等功能。

4. 數(shù)據(jù)判讀

實現(xiàn)實驗數(shù)據(jù)的自動判讀,采集到的測試數(shù)據(jù)導入數(shù)據(jù)庫后,通過用戶預(yù)先設(shè)定的執(zhí)行標準及判讀規(guī)則,實現(xiàn)對數(shù)據(jù)超差情況的自動判讀,并對判讀結(jié)果進行不同顏色的對比顯示(如實驗值在標準范圍內(nèi)為綠色,在標準范圍外為紅色等)。

4.?報告生成

實現(xiàn)“一鍵式”報告生成,可以根據(jù)預(yù)先定義的報告模板,自動填充實驗數(shù)據(jù)信息到報告模板中,快速生成實驗報告。

利用實驗室信息化管理平臺LIMS——數(shù)據(jù)管理功能,可將實驗業(yè)務(wù)正個流程數(shù)據(jù)進行標準化應(yīng)用管理,并借助大數(shù)據(jù)技術(shù)進行可視化的數(shù)據(jù)分析與提煉,豐富的數(shù)據(jù)分析報表功能還可實現(xiàn)導出、跨平臺分享等。

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